Série d'ateliers 2012

Date : Le lundi 14 mai 2012

Endroit : Université de la Saskatchewan, Saskatoon (Saskatchewan)

Options des ateliers :

• Introduction à une enquête relative à une poussée d’origine alimentaire (journée complète)
• Modèles statistiques avancés pour l’épidémiologie : modèles à niveaux multiples; modèles à effets aléatoires et équations d’estimation généralisées (journée complète)
• Introduction à la conception de base de données EpiData (demi-journée)
• Introduction aux modèles d’équations structurelles pour les statistiques en santé

Inscription : Inscrire par utiliser le formulaire d'inscription téléchargeable.

Frais :
Les étudiants inscrits au Congrès des étudiants de la SCEB paient un somme forfaitaire de 75 $ de plus pour assister à n’importe quel atelier d’une demi-journée ou journée plein. Les étudiants peuvent s’inscrire au congrès ici : http://www.studentcseb.ca/fr/inscription/.

 

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Grandes lignes des ateliers et biographies des conférenciers :

1. Introduction à une enquête relative à une poussée d’origine alimentaire
Dr Joanne Tataryn, Mme Teresa Leung et Mme Meghan Hamel
Division de la gestion des éclosions, Centre des maladies infectieuses d’origine alimentaire, environnementale et zoonotique (CMIOAEZ), Agence de la santé publique du Canada (ASPC)

Endroit : À annoncer
Heure : De 8 h 30 à 16 h 30 (journée complète)
Atelier payant : Oui
Capacité : 30

Description :
Les participants feront l’essai de leurs habiletés pour enquêter sur les maladies, à l’aide d’une étude de cas portant sur une grosse poussée d’origine alimentaire. Parmi le sujet couvert se trouvent la conception de questionnaires, les définitions de cas, les enquêtes environnementales, l’épidémiologie descriptive et analytique, puis l’utilisation de données pour guider les interventions en santé publique. Les participants quitteront l’atelier avec une compréhension des enquêtes sur une poussée d’origine alimentaire au Canada, ainsi que de la sélection, de la conception et de l’analyse d’une étude analytique pendant une poussée.

Auditoire ciblé :
Les étudiants en épidémiologie et les professionnels de la santé publique qui veulent en apprendre davantage à propos des enquêtes sur les poussées d’origine alimentaire au Canada et sur le recours aux principes des enquêtes sur les poussées épidémiologiques.

Préalables :
Compréhension de base des étapes d’une enquête sur une poussée (lecture de cours); connaissance de Microsoft Excel

Objectif du cours :
Donner aux étudiants et aux professionnels de la santé publique un aperçu d’enquête sur une éclosion entérique au Canada et une occasion de se servir des habiletés en enquête sur les poussées.

Objectifs d’apprentissage :
Les objectifs de l’apprentissage de ce cours sont les suivants :

• Utiliser les principes épidémiologiques pendant une enquête relative à une poussée d’origine alimentaire.
• Faire des exercices d’analyse et d’interprétation de données.
• Développer et vérifier une hypothèse afin de décrire la cause d’une poussée.

Biographies des conférenciers :
Dr Joanne Tataryn, épidémiologiste principale, Division de la gestion des éclosions, Centre des maladies infectieuses d’origine alimentaire, environnementale et zoonotique (CMIOAEZ), Agence de la santé publique du Canada (ASPC)

Dr Joanne Tataryn est épidemiologiste principale à la Division de la gestion des éclosions, Centre des maladies infectieuses d’origine alimentaire, environnementale et zoonotique (CMIOAEZ), Agence de la santé publique du Canada (ASPC). Mme Tataryn a obtenu son doctorat en médecine vétérinaire au Western College of Veterinary Medicine (WCVM) en 1999 et, après la remise de son diplôme, a travaillé â titre d’adjointe clinique au WCVM et d’inspectrice vétérinaire à l’Agence canadienne d’inspection des aliments (ACIA). Elle est retournée à l’université en 2005 afin d’obtenir une maîtrise en épidémiologie à l’Université de la Saskatchewan, se concentrant sur les méthodes d’évaluation et d’amélioration des systèmes de surveillance.

Mme Tataryn s’intéresse beaucoup à la recherche épidémiologique appliquée, à la surveillance des poussées, à leur gestion et aux enquêtes connexes. Pendant qu’elle travaillait à l’ACIA, elle a participé aux travaux sur la grande épidémie de grippe aviaire à Abbotsford, en C.-B., en 2004, et sur la grande contagion épizootique à l’anthrax en Saskatchewanm, en 2006. En 2007, elle joignait le Programme canadien d’épidémiologie de terrain (PCET) à l’ASPC, afin de perfectionner ses habiletés en enquête sur les poussées et de diversifier ses connaissances et son expérience en santé publique. À l ‘ASPC, elle a travaillé à la Saskatoon Health Region et sur une variété de problèmes de santé publique, y compris le virus du Nil occidental, des poussées de maladie d’origine alimentaire et la surveillance d’anomalies congénitales.

Depuis son arrivée à la Division de la gestion des éclosions, en novembre 2010, Mme Tataryn a mis l’accent sur les enquêtes relatives aux poussées d’origine alimentaire et aux réactions connexes, puis travaillé sur un certain nombre de poussées nationales récentes. Son bureau est à l’Université de la Saskatchewan.

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Meghan Hamel, agente de la santé publique et épidémiologiste à la Division de la gestion des éclosions, Centre des maladies infectieuses d’origine alimentaire, environnementale et zoonotique (CMIOAEZ), Agence de la santé publique du Canada

Meghan Hamel est agente de la santé publique et épidemiologiste à la Division de la gestion des éclosions, Centre des maladies infectieuses d’origine alimentaire, environnementale et zoonotique (CMIOAEZ), Agence de la santé publique du Canada (ASPC). Mme Hamel est diplômée de premier cycle en microbiologie et en immunologie de l’Université McGill; elle a une maîtrise en épidémiologie de l’Université Queen’s depuis 2007.

Avant de se joindre à Division de la gestion des éclosions, en décembre 2010, Mme Hamel travaillait au ministère de la Santé de l’Î-P.-É. à titre d’épidémiologiste dans le domaine des maladies infectieuses, faisant de la surveillance de maladies et s’occupant d’interventions pour la province.

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Teresa Leung, épidémiologiste, Division de la gestion des éclosions (DGE), Agence de la santé publique du Canada

Teresa Leung est épidemiologiste à la Division de la gestion des éclosions (DGE), Agence de la santé publique du Canada. Avant de travailler à la DGE, Mme Leung a achevé le Programme canadien d’épidémiologie de terrain à la Vancouver Coastal Health Authority, où elle apportait un soutien aux activités de surveillance, y compris la surveillance de rassemblements de masses pour les Jeux olympiques de 2010 et des enquêtes sur des poussées. Elle a également participé au programme mondial Stop Transmission of Polio (STOP), afin de renforcer les activités de surveillance et d’immunisation pour la paralysie flasque aiguë ainsi que pour la rougeole et le tétanos néonatal. Mme Leung a aussi travaillé dans d’autres domaines de l’ASPC, y compris les maladies respiratoires infectieuses, la protection civile et les interventions

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2. Modélisation multiniveau
Yutaka Yasui, Ph.D.
Department of Public Health Sciences, Université de l’Alberta

Endroit : À annoncer
Heure : De 8 h 30 à 16 h 30 (journée complète)
Atelier gratuit : Oui
Capacité : 30

Description :
Dans ce cours, on abordera les rôles des modèles statistiques dans la recherche en épidémiologie et en santé publique; les examens d’analyse de régression de base; le concept de « corrélation des résultats » et son application aux modèles; les équations d’estimation généralisées : méthodes et applications; les modèles à effets aléatoires : méthodes et applications; l’analyse à niveaux multiples, et les essais de randomisation de groupes.

Tout au cours de l’atelier, on mettra l’accent sur des exemples tirés de la littérature et les applications des méthodes à des données réelles à l’aide de SAS ou de STATA.

Prérequis :
Concepts et méthodes d’analyse de régression de base avec des modèles multiples de régression linéaire et logistique. Capacité d’effectuer une analyse de régression de base avec des modèles multiples de régression linéaire et logistique dans SAS ou STATA.

Objectif du cours :
Présenter les concepts et les méthodes d’analyse de régression avancée – et effectuer des exercices pratiques avec SAS et STATA – aux étudiants diplômés en épidémiologie et autres domaines de la santé publique, y compris l’analyse à niveaux multiples, les modèles à effets aléatoires et les équations d’estimation généralisées.

Requis technique:
Les participants doivent apporter un ordinateur portable avec le SAS et / ou STATA téléchargé.

Lectures recommandées :
Examen des modèles statistiques de base pour l’épidémiologie.

Statistical Models for Epidemiology par Clayton and Hills, Presses de l’Université d’Oxford.

Biographie du formateur :
Yutaka Yasui, professeur, Département des sciences de santé publique, Université de l’Alberta

Les travaux de recherche de M. Yutaka Yasui portent principalement sur l’élaboration et l’application de méthodes biostatistiques et épidémiologiques à l’intersection de la biologie et des sciences de la santé publique et cliniques. Les membres de son groupe de recherche collaborent étroitement entre eux et avec d’éminents chercheurs locaux, nationaux et internationaux oeuvrant dans divers domaines liés aux sciences de la santé. Parmi leurs contribution à la recherche, citons : (1) l’élaboration de méthodes quantitatives de pointe et l’application d’une rigueur méthodologique aux projets de recherche concertée; et, (2) l’élaboration de méthodes adéquates/meilleures pour faire avancer la découverte et l’application des connaissances.

Diplômes :

• Ph.D., Université Johns Hopkins, École d’hygiène et de santé publique, 1994
• B.S., Université de Kyoto, École de génie, 1989
  

Prix et distinctions :

• Chaire de recherche du Canada, Programme des chaires de recherche du Canada, 2005-2015
• Health Senior Scholar Award, (prix du chercheur principal en santé) Alberta Innovates –
• Health Solutions, 2006-2013
• Award of Excellence in Graduate Teaching (prix d’excellence en enseignement aux cycles supérieurs), Public Health Sciences Students’ Association, 2009
• Award of Excellence in Graduate Teaching (prix d’excellence en enseignement aux cycles supérieurs), Public Health Sciences Students’ Association, 2007

Bibliographie sommaire :

• Yasui, Y., Lele, S. (1997). « A regression method for spatial disease rates: An estimating function approach. » Journal of the American Statistical Association 92:21-32.
• Yasui, Y., Pepe, M., Thompson, M.L., Adam, B.L., Wright, G., Jr., Qu, Y., Potter, J.D., Winget, M., Thornquist, M., Feng, Z. (2003). « A data-analytic strategy for protein-biomarker discovery: Profiling of high-dimensional proteomic data for cancer detection. » Biostatistics 4(3):449-63.
• Yasui, Y., Liu, Y., Neglia, J., Friedman, D., Bhatia, S., Meadows, A., Diller, L., Mertens, A., Whitton, J., Robison, L.L. (2003). « A methodological issue in the analysis of second cancer incidence in long-term survivors of childhood cancers. » American Journal of Epidemiology. 158(11):1108-13.
• Yasui, Y., Feng, Z., Diehr, P., McLerran, D., Beresford, S.A.A., McCulloch, C.E. (2004). « Evaluation of community intervention trials via generalized linear mixed models. » Biometrics 60:1043-52.
• Dinu, I., Potter, J.D., Mueller, T., Liu, Q., Adewale, A.J., Jhangri, G.S., Einecke, G., Famulski, K.S., Halloran, P., Yasui Y. (2007). « Improving gene set analysis of microarray data by SAM-GS. » BMC Bioinformatics 8:242.
  

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3. Introduction à la conception de base de données EpiData
Bijay Adhikari, Ph.D.
Ministère de la Santé de la Saskatchewan

Pièce : À annoncer
Heure : De 12 h à 16 h 30 (demi-journée)
Atelier payant : Oui
Capacité : 30

Description :
Après le cours, les participants devraient être capables d’utiliser EpiData Entry pour créer un système d’entrée de données reposant sur le questionnaire, de construire un formulaire de base de données et de protéger la base de données contre un certain nombre d’erreurs d’intrants, par la rédaction d’un programme de vérification. Ils devraient être aussi en mesure d’utiliser certaines caractéristiques d’EpiData Entry aux menus Outils et Document, ainsi qu’importer et exporter des données.

Préalables :

• Aucune connaissance préalable d’EpiData Entry n’est supposée.
• Une compréhension de base de MS Excel est utile.
• Une compréhension de calculs statistiques simples est utile.
• Compétences informatiques de base.
• Des lectures seront fournies au moins deux semaines avant la séance.
  

Objectif du cours :
Offrir aux participants une introduction solide à EpiData Entry.

Biographies des conférenciers :
Bijay Adhikari, Ph.D., M.H.P., D.M.V., épidémiologiste provincial des maladies infectieuses, ministère de la Santé de la Saskatchewan

Bijay Adhikari a obtenu son diplôme de vétérinaire à l’Université de Tribhuvan, au Népal. Après des années de service public à Kathmandu, il est allé à l’Université Massey, en Nouvelle-Zélande, et a obtenu une maîtrise en santé publique en 2003. En 2008, M. Adhikari terminait son Ph.D. en médecine vétérinaire (épidémiologie) à l’Université de l’État de Washington. Il a travaillé à l’Université de l’Ohio à titre de chercheur postdoctoral avant de se joindre à l’Agence de la santé publique du Canada (ASPC) comme agent de surveillance de l’immunisation à Regina, en Saskatchewan, puis de travailler au ministère de la Santé de la Saskatchewan. M. Adhikari est actuellement épidémiologiste provincial des maladies infectieuses, au ministère de la Santé de la Saskatchewan. Travailler avec les données et la base de données est son principal intérêt, et il a conçu un certain nombre de bases de données à l’aide d’EpiData et d’EpiInfo.

Articles sélectionnés, revus par les pairs :

• Taylor J., Galanis E., Stone J., Ekkert J., Quibell, D., Wilcott L., Hoang L., McCormick R., Whitfield Y., Adhikari B., Grant C., Sharma D., 2011. An Outbreak of Salmonella Chester in Canada: Rare Serotype, Uncommon Exposure and Unusual Population Demographic Facilitate Rapid Identification of Food Vehicle. Journal of Food Protection (accepté).
• Redgate L, Garner M, McConnell A, Adhikari B, Holt T, Robichaud S, Jones A, Brindamour M, Tan B., 2011. Characteristics of Children Hospitalized with Pandemic Influenza (pH1N1) Infection in Saskatoon, 2009-2010 Flu Season. PLoS One (sous presse).
• Adhikari B., Besser T. E., Gay J. M., Fox L. K., Hancock D. D., Davis M. A., 2010. Multilocus Variable Number of Tandem Repeats Analysis and Plasmid Profiling to Study the Occurrence of blaCMY-2 within a PFGE-defined Clade of Salmonella Enterica Serovar Typhimurium. Applied and Environmental Microbiology. 76 (1): 69-74.
  

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4. Introduction aux modèles d’équations structurelles pour les statistiques en santé
Lisa Lix, Ph.D., P.Stat.
École de santé publique, Université de Saskatchewan

Endroit : À déterminer
Heure : 8 h 30 à midi (demi-journée)
Frais : oui
Capacité : 22

Description :
Les modèles d’équations structurelles (MES) permettent aux chercheurs de tester les relations complexes pour des variables dépendantes multiples et d’examiner à la fois les effets directs et indirects des variables indépendantes. Ces modèles sont de plus en plus utilisés dans la recherche clinique et épidémiologique, en particulier dans l’analyse des résultats rapportés par les patients et pour aborder l’erreur de mesure dans les études épidémiologiques.

Prérequis :
Les participants devraient posséder des notions sur l’analyse de régression multiple.

Objectif du cours :

À la fin de l’atelier, les participants pourront :

• Décrire les différences entre les trois différents types de modèles d’équations structurelles :
• Modèles causaux pour les variables observées directement,
• Modèles de mesure et analyse du facteur de confirmation,
• Modèles de régression structurelle avec variables latentes;
• Connaître la théorie statistique qui sous-tend la MES;
• Cerner les avantages de la MES par rapport aux techniques d’analyse conventionnelles;
• Décrire les applications potentielles de la MES en sciences de la santé;
• Suivre les étapes pour intégrer la MES à un ensemble de données réelles.
  

Biographie de la formatrice :
Lisa Lix, professeure agrégée et chaire de recherche du centenaire, École de santé publique, Université de la Saskatchewan

Lisa Lix est professeure agrégée et chaire de recherche du centenaire à l’École de santé publique de l’Université de la Saskatchewan. Elle est biostatisticienne et chercheure en services de santé et s’intéresse, entre autres, à la méthodologie de la recherche sur les services de santé, à la qualité des bases de données administratives sur la santé, à l’erreur de mesure, à l’analyse des mesures répétées et des données longitudinales, ainsi qu’aux méthodes statistiques robustes pour les données multivariées.

Références pertinentes :

• Lix, L. M., Acan, B., Adachi, J. D., Towheed, T., Davison, S., Hopman, W. et Leslie, W.D. (sous presse). « Measurement equivalence of the SF-36 in the Canadian Multicentre Osteoporosis Study. » Health and Quality of Life Outcomes.
• Barclay-Goddard, R., Lix, L. M., Tate, R., Weinberg, L. et Mayo, N. E. (2011). « Health related quality of life after stroke: Does response shift occur in self perceived physical function? » Archives of Physical Medicine and Rehabilitation, 92, 1762-1769.
• Lix, L. M. et Sajobi, T. T. (2010). « Testing multiple outcomes in repeated measures designs. » Psychological Methods 15(3), 268-280.
• Lix, L. M., Metge, C. M. et Leslie, W. D. (2009). « Measurement equivalence of osteoporosis-specific and general quality-of-life instruments in Aboriginal and non-Aboriginal women. » Quality of Life Research, 18, 619-627.